ਗੁਰੂ ਅਰਜਨ ਦੇਵ ਦੇ ਵਧਦੇ ਪ੍ਰਭਾਵ ਅਤੇ ਸਫਲਤਾ ਨੇ ਮੁਗਲ ਸਾਮਰਾਜ ਦਾ ਧਿਆਨ ਖਿੱਚਿਆ. ਗੁਰੂ ਅਰਜਨ ਦੇਵ ਜੀ ਨੂੰ ਮੁਗਲ ਬਾਦਸ਼ਾਹ ਜਹਾਂਗੀਰ ਦੇ ਆਦੇਸ਼ਾਂ ਅਧੀਨ ਗ੍ਰਿਫਤਾਰ ਕਰ ਲਿਆ ਗਿਆ ਅਤੇ ਇਸਲਾਮ ਕਬੂਲ ਕਰਨ ਲਈ ਕਿਹਾ ਗਿਆ। [32] ਉਸਨੇ ਇਨਕਾਰ ਕਰ ਦਿੱਤਾ, 1606 ਈਸਵੀ ਵਿੱਚ ਤਸੀਹੇ ਦਿੱਤੇ ਗਏ ਅਤੇ ਉਸਨੂੰ ਫਾਂਸੀ ਦਿੱਤੀ ਗਈ. [32] [33] [34] ਗੁਰੂ ਅਰਜਨ ਦੇਵ ਜੀ ਦੇ ਪੁੱਤਰ ਅਤੇ ਉੱਤਰਾਧਿਕਾਰੀ ਗੁਰੂ ਹਰਗੋਬਿੰਦ ਨੇ ਜ਼ੁਲਮ ਤੋਂ ਬਚਣ ਅਤੇ ਸਿੱਖ ਪੰਥ ਨੂੰ ਬਚਾਉਣ ਲਈ ਅੰਮ੍ਰਿਤਸਰ ਛੱਡ ਦਿੱਤਾ ਅਤੇ ਸ਼ਿਵਾਲਿਕ ਪਹਾੜੀਆਂ ਵਿੱਚ ਚਲੇ ਗਏ। [35] ਗੁਰੂ ਅਰਜਨ ਦੇਵ ਜੀ ਦੀ ਸ਼ਹਾਦਤ, ਰਾਜ ਲੂਯਿਸ ਈ. ਫੇਨੇਚ ਅਤੇ ਡਬਲਯੂ. ਐਚ. ਮੈਕਲਿਉਡ ਦੀ ਸ਼ਹਾਦਤ ਤੋਂ ਬਾਅਦ ਤਕਰੀਬਨ
ਇੱਕ ਸਦੀ ਤੱਕ, ਗੋਲਡਨ ਟੈਂਪਲ ਉੱਤੇ ਅਸਲ ਸਿੱਖ ਗੁਰੂਆਂ ਦਾ ਕਬਜ਼ਾ ਨਹੀਂ ਸੀ ਅਤੇ ਇਹ ਦੁਸ਼ਮਣੀ ਸੰਪਰਦਾਇਕ ਹੱਥਾਂ ਵਿੱਚ ਰਿਹਾ। [35] 18 ਵੀਂ ਸਦੀ ਵਿੱਚ, ਗੁਰੂ ਗੋਬਿੰਦ ਸਿੰਘ ਅਤੇ ਉਨ੍ਹਾਂ ਦੇ ਨਵੇਂ ਸਥਾਪਿਤ ਖਾਲਸਾ ਸਿੱਖ ਵਾਪਸ ਆਏ ਅਤੇ ਇਸਨੂੰ ਆਜ਼ਾਦ ਕਰਵਾਉਣ ਲਈ ਲੜਾਈ ਲੜੀ। [35] ਗੋਲਡਨ ਟੈਂਪਲ ਨੂੰ ਮੁਗਲ ਸ਼ਾਸਕਾਂ ਅਤੇ ਅਫਗਾਨ ਸੁਲਤਾਨਾਂ ਦੁਆਰਾ ਸਿੱਖ ਧਰਮ ਦਾ ਕੇਂਦਰ ਮੰਨਿਆ ਜਾਂਦਾ ਸੀ ਅਤੇ ਇਹ ਅਤਿਆਚਾਰ ਦਾ ਮੁੱਖ ਨਿਸ਼ਾਨਾ ਰਿਹਾ. [8]
1709 ਵਿੱਚ ਲਾਹੌਰ ਦੇ ਗਵਰਨਰ ਨੇ ਆਪਣੀ ਫੌਜ ਭੇਜ ਕੇ ਸਿੱਖਾਂ ਨੂੰ ਵਿਸਾਖੀ ਅਤੇ ਦੀਵਾਲੀ ਦੇ ਤਿਉਹਾਰਾਂ ਲਈ ਇਕੱਠੇ ਹੋਣ ਤੋਂ ਰੋਕਿਆ। ਪਰ ਸਿੱਖਾਂ ਨੇ ਹਰਿਮੰਦਰ ਸਾਹਿਬ ਵਿੱਚ ਇਕੱਠੇ ਹੋ ਕੇ ਇਨਕਾਰ ਕਰ ਦਿੱਤਾ। 1716 ਵਿੱਚ, ਬੰਦਾ ਸਿੰਘ ਅਤੇ ਬਹੁਤ ਸਾਰੇ ਸਿੱਖਾਂ ਨੂੰ ਗ੍ਰਿਫਤਾਰ ਕਰ ਲਿਆ ਗਿਆ ਅਤੇ ਫਾਂਸੀ ਦਿੱਤੀ ਗਈ।
1737 ਵਿੱਚ, ਮੁਗਲ ਗਵਰਨਰ ਨੇ ਮਨੀ ਸਿੰਘ ਨਾਂ ਦੇ ਹਰਿਮੰਦਰ ਸਾਹਿਬ ਦੇ ਰਖਵਾਲੇ ਨੂੰ ਫੜਨ ਦਾ ਹੁਕਮ ਦਿੱਤਾ ਅਤੇ ਉਸਨੂੰ ਫਾਂਸੀ ਦੇ ਦਿੱਤੀ। ਉਸਨੇ ਮਸੇ ਖਾਨ ਨੂੰ ਪੁਲਿਸ ਕਮਿਸ਼ਨਰ ਨਿਯੁਕਤ ਕੀਤਾ ਜਿਸਨੇ ਫਿਰ ਮੰਦਰ ਤੇ ਕਬਜ਼ਾ ਕਰ ਲਿਆ ਅਤੇ ਇਸਨੂੰ ਨੱਚਣ ਵਾਲੀਆਂ ਲੜਕੀਆਂ ਨਾਲ ਆਪਣੇ ਮਨੋਰੰਜਨ ਕੇਂਦਰ ਵਿੱਚ ਬਦਲ ਦਿੱਤਾ. ਉਸ ਨੇ ਪੂਲ ਨੂੰ ਧੋਖਾ ਦਿੱਤਾ.
ਸਿੱਖਾਂ ਨੇ ਅਗਸਤ 1740 ਵਿੱਚ ਮੰਦਰ ਦੇ ਅੰਦਰ ਮਸੇ ਖਾਨ ਦੀ ਹੱਤਿਆ ਕਰਕੇ ਹਰਿਮੰਦਰ ਸਾਹਿਬ ਦੀ ਬੇਅਦਬੀ ਦਾ ਬਦਲਾ ਲਿਆ।
1746 ਵਿੱਚ, ਲਾਹੌਰ ਦੇ ਇੱਕ ਹੋਰ ਅਧਿਕਾਰੀ ਦੀਵਾਨ ਲਖਪਤ ਰਾਏ ਨੇ ਯਹੀਆ ਖਾਨ ਲਈ ਕੰਮ ਕੀਤਾ ਅਤੇ ਆਪਣੇ ਭਰਾ ਦੀ ਮੌਤ ਦਾ ਬਦਲਾ ਲੈਣ ਲਈ, ਤਲਾਬ ਨੂੰ ਰੇਤ ਨਾਲ ਭਰ ਦਿੱਤਾ। 1749 ਵਿੱਚ, ਸਿੱਖਾਂ ਨੇ ਤਲਾਬ ਨੂੰ ਬਹਾਲ ਕੀਤਾ ਜਦੋਂ ਮੁਇਨ ਉਲ-ਮੁਲਕ ਨੇ ਸਿੱਖਾਂ ਵਿਰੁੱਧ ਮੁਗਲ ਕਾਰਵਾਈਆਂ ਨੂੰ ਸੁਸਤ ਕਰ ਦਿੱਤਾ ਅਤੇ ਮੁਲਤਾਨ ਵਿੱਚ ਉਸ ਦੇ ਕਾਰਜਾਂ
ਦੌਰਾਨ ਉਨ੍ਹਾਂ ਦੀ ਮਦਦ ਮੰਗੀ।
1757 ਵਿੱਚ, ਅਫਗਾਨ ਸ਼ਾਸਕ ਅਹਿਮਦ ਸ਼ਾਹ ਦੁਰਾਨੀ, ਜਿਸਨੂੰ ਅਹਿਮਦ ਸ਼ਾਹ ਅਬਦਾਲੀ ਵੀ ਕਿਹਾ ਜਾਂਦਾ ਹੈ, ਨੇ ਅੰਮ੍ਰਿਤਸਰ ਉੱਤੇ ਹਮਲਾ ਕੀਤਾ ਅਤੇ ਹਰਿਮੰਦਰ ਸਾਹਿਬ ਦੀ ਬੇਅਦਬੀ ਕੀਤੀ। ਉਸਨੇ ਅਫਗਾਨਿਸਤਾਨ ਜਾਣ ਤੋਂ ਪਹਿਲਾਂ, ਕੱਟੀਆਂ ਹੋਈਆਂ ਗਾਵਾਂ ਦੇ ਅੰਦਰੂਨੀ ਤਲਾਅ ਦੇ ਨਾਲ ਪੂਲ ਵਿੱਚ ਡੋਲ੍ਹ ਦਿੱਤਾ ਸੀ. ਸਿੱਖਾਂ ਨੇ ਇਸਨੂੰ ਦੁਬਾਰਾ ਬਹਾਲ ਕੀਤਾ.
